ゲネス人の生き残りと会った話をサユキに伝えるコウセイ。ソラトは何か上の空。

世界中で怪獣出現のペースが上がる中、福島県で怪現象を調査する怪特隊は怪獣に遭遇。

しかしソラトは変身出来ず苦しんでいる。記憶が戻りかけているのか。特定の生命体に肩入れしてはいけないという本来の任務に戻るのか。

対怪獣の作戦が高出力のレーザー砲を使用して行われる。奇しくも怪獣ガイリュウガと同じ方式。

だが作戦開始後ペグノスが飛来…するがガイリュウガに一蹴されてしまう。オメガに変身しガイリュウガに立ち向かうソラトだが活動を停止。メテオ怪獣を回収して去ってしまう。サユキとアユムにソラト（オメガ）はもう戻らないと話すコウセイ。

はたしてこの先どうなるか、というところで次回は総集編。しかし最終章を告げるCMが続くぞ。